Các sai phạm được kết luận nêu ra gồm: việc quản lý, sử dụng, quyết toán kinh phí cấp bù, miễn giảm học phí sư phạm do Bộ GD-ĐT cấp cho trường trong năm 2014 có nhiều sai phạm dẫn đến phải thu hồi số tiền sử dụng không đúng mục đích là 11,041 tỷ đồng; việc thu, quản lý, sử dụng tiền mở lớp ôn tập thi cao học, lớp bồi dưỡng nâng cao kiến thức chuyên môn, lớp ôn tập và thi sát hạch tiếng Anh, có nhiều sai phạm, thực hiện không đúng quy định; sau khi có Kết luận thanh tra số 01/KL-TTr ngày 29-1-2018 của Thanh tra Bộ GD-ĐT (Báo SGGP đã phản ánh qua bài viết “Hàng loạt sai phạm tại Trường ĐH Sư phạm Kỹ thuật TPHCM”, đăng ngày 28-2-2018), Bộ GD-ĐT đã yêu cầu trường chấm dứt việc cấp chứng chỉ bồi dưỡng sau đại học không đúng quy định nhưng lãnh đạo trường không quyết liệt chỉ đạo chấm dứt thực hiện việc cho phép chuyển điểm đối với chương trình bồi dưỡng nâng cao kiến thức.
Về trách nhiệm, Thanh tra Bộ GD-ĐT kết luận: Đối với việc quản lý, sử dụng, quyết toán kinh phí cấp bù học phí sinh viên sư phạm; cấp bù tiền miễn, giảm học phí do Bộ GD-ĐT cấp trong năm 2014 cho trường thuộc trách nhiệm của ông Đỗ Văn Dũng, hiệu trưởng, chịu trách nhiệm với vai trò người đứng đầu, chủ tài khoản trong việc quản lý, sử dụng, quyết toán kinh phí cấp bù học phí sinh viên sư phạm, cấp bù tiền miễn, giảm học phí không đúng quy định. Ông Lê Hiếu Giang, phó hiệu trưởng, chịu trách nhiệm với vai trò phụ trách công tác đào tạo và công tác học sinh, sinh viên, khi cùng bà Trương Thị Hiên ký bảng kê chứng từ thanh toán và danh sách chi trả tiền miễn, giảm học phí không đúng quy định.
Với những sai phạm trên, Thanh tra Bộ GD-ĐT kiến nghị trường phải chấm dứt việc cho phép học viên hoàn thành chương trình bồi dưỡng nâng cao kiến thức chuyên môn được chuyển điểm, miễn học môn học đã học trong chương trình này khi học chương trình đào tạo trình độ thạc sĩ của trường; chấn chỉnh công tác quản lý tài chính, quản lý đào tạo và phát hành văn bản hành chính. Tổ chức xem xét kiểm điểm trách nhiệm đối với các đơn vị, cá nhân có liên quan thuộc thẩm quyền quản lý của trường trong việc để xảy ra các hạn chế, thiếu sót, sai phạm nêu tại kết luận thanh tra. Thanh tra kiến nghị đơn vị thuộc Bộ GD-ĐT kiểm tra, giám sát trường trong việc kiểm điểm, xử lý trách nhiệm của các đơn vị, cá nhân có liên quan đến các hạn chế, thiếu sót, sai phạm theo đúng quy định.
