Căn cứ quyết định của Thủ tướng, Tổng cục Thủy lợi và Tổng cục Phòng chống thiên tai, mỗi đơn vị sẽ có 9 đầu mối trực thuộc.
Hiện cơ cấu vị trí lãnh đạo của các tổng cục đã được lãnh đạo Bộ NN-PTNT hoàn thiện trình Thủ tướng chấp thuận, thẩm quyền bổ nhiệm sẽ do Bộ trưởng Bộ NN-PTNT quyết định.
Dự kiến ngày 18-8, Bộ NN-PTNT sẽ tổ chức công bố các quyết định của Thủ tướng về việc thành lập 2 tổng cục và các quyết định bổ nhiệm lãnh đạo tổng cục của Bộ trưởng Bộ NN-PTNT.